.cram Extensão de arquivo
Tipo de arquivo Compressed Alignment File
| Desenvolvedor | EBI |
| Categoria | Data Files |
| Formato | Binary |
.CRAM opção número
Formato de arquivo de alinhamento comprimido desenvolvido pelo EBI, uma estação do Laboratório Europeu de Biologia Molecular; armazena alinhamentos de leitura de sequência de DNA curto gerados a partir de alinhadores de leitura curta, como BWA, BBMap e BLAT.
O formato de arquivo CRAM é semelhante ao formato de arquivo Binary Alignment / Map (BAM), mas apresenta melhor compactação de arquivos e um formato de recipiente binário orientado a colunas reestruturado. Conforme os volumes de dados aumentam no campo do software genético, o formato CRAM foi projetado para reduzir a impressão do pé do disco dos dados de alinhamento.
Alinhamento de leitura curto é o processo de decifrar de onde uma sequência vem no genoma. Isso pode ser difícil, já que o genoma de referência é bastante grande e nem sempre você está procurando por correspondências exatas no genoma de referência. Alinhadores de leitura curta são usados para pesquisar sequências enormes para correspondências e correspondências aproximadas. Como as sequências são tão grandes, a compactação fornecida por formatos como o CRAM é necessária para manter os tamanhos dos arquivos gerenciáveis.
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